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金花清感颗粒防治新型冠状病毒肺炎的潜在药效物质研究

网络整理 2020-04-04 17:50

  2019年12月以来,中国湖北省武汉地区发现新型冠状病毒感染的肺炎患者,随后疫情开始迅速蔓延全国。截至3月8日24时,据31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告,累计报告确诊病例80 735例,现存重症患者5 111例。世界卫生组织将其列为国际关注的突发公共卫生事件,并将新型冠状病毒感染的肺炎命名为“COVID-19”(coronavirus disease 2019)。国际病毒分类委员会将新型冠状病毒命名为“SARS-CoV- 2”,具有传播迅速、传染性强、人群普遍易感等特点,并以发热、乏力及干咳等作为临床主要症状,重症患者则出现呼吸困难、呼吸窘迫综合征及脓毒性休克等。目前,临床尚未出现针对SARS-CoV-2的有效且特异性药物与疫苗,西医主要采用传统的抗病毒药物进行治疗,其不良反应较大且一定程度上缺乏循证依据。中医具有整体观与辨证施治的优势,对该类疫病的认识悠久历史,积累了一系列行之有效的治疗方法。在国家卫生健康委发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行)》(以下简称《诊疗方案》)第三版至第七版中,中药处方与成方制剂对不同时期COVID-19患者的应用均取得良好的临床疗效。

  金花清感颗粒是在2009年北京地区H1N1流感流行期间,北京市中医药管理局组织中西医学专家攻关论证,参考《伤寒论》《瘟疫论》《温病条辨》等中医经典古籍中的百余个处方,借鉴临床专家成果,历经反复筛选并优化而成。金花清感颗粒组方来源于银翘散和麻杏石甘汤方的加减,由金银花、石膏、炙麻黄、知母、连翘、苦杏仁、黄芩、牛蒡子、薄荷、青蒿、浙贝母、甘草共12味药材组成,具有疏风宣肺、清热解毒之功效。组方药味以苦寒药为主,可用于外感时邪引发的发热,恶寒轻或不恶寒,咽红肿痛,咳嗽或咳而有痰。在《诊疗方案》第四版至第七版中,均将金花清感颗粒作为对处医学观察期中具有乏力伴发热症状的推荐中成药。据张伯礼院士介绍,目前已开展的关于金花清感颗粒治疗COVID-19的2项研究表明,该方对于轻度及普通型患者疗效确切,主要体现在退热时间、症状、核酸转阴时间及炎症吸收方面,且有效控制轻症患者的转重率。因此,采用生物信息学手段,对金花清感颗粒防治COVID-19潜在的化学与生物学特征进行初步分析,可为该方进一步的实验研究与二次开发奠定基础。网络药理学是运用系统生物学、高通量筛选、网络分析及网络可视化等多种技术,揭示“疾病-基因-靶标-药物”相互作用复杂体系,从整体性与系统性的角度探析药物对机体疾病网络的干预与影响。基于药物与药物之间结构、功效等方面的相似性,结合机体靶标分子、生物效应的复杂相互作用关系,通过构建药物-药物、药物-靶标等网络,可有效预测药物功能或特定功能所对应的药物,是目前中药药效物质基础研究的重要手段之一。分子对接技术是一种基于受体大分子三维结构与配体化合物的结合作用,通过计算物理化学参数评价二者间的相互作用,从而达到辅助药物筛选的目的,现已广泛用于基于特定靶标的中药及复方活性成分研究。本研究采用网络分析结合分子对接技术,探讨金花清感颗粒中抗COVID-19的潜在物质基础与作用机制,以期为金花清感颗粒防治COVID-19提供科学依据与临床应用参考。

  1 材料

  本研究材料为数据库与数据分析软件,其中数据库包括中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,)、靶点蛋白数据库UniProt(https://www.uniprot.org/)、基因功能与信号通路富集分析数据库DAVID(https:// david.ncifcrf.gov/home.jsp)、RSCB蛋白质结构数据库PDB(https://www.rcsb.org/)、小分子化合物结构查询数据库PubChem(https:// pubchem.ncbi. nlm.nih.gov/);分析软件包括网络拓扑分析软件Cytoscape 3.2.1、分子对接软件AutoDock Vina、Open Bable GUI、Sybyl及数据可视化软件Graphpad Prism 8、Discovery Studio及在线绘图站Omishare( tools/index.php/)。

  2 方法

  2.1 金花清感颗粒中活性化合物及靶标蛋白的筛选

  通过TCMSP,以金花清感颗粒中所含11味药材为关键词检索其化学成分。以口服生物利用度(oralbioavailability,OB)及类药性(drug like,DL)为指标进一步遴选各药味中化学成分[16]。其中,筛选金银花、炙麻黄、石膏、苦杏仁、黄芩、连翘、浙贝母、知母、牛蒡子、青蒿、薄荷化合物中符合OB≥30%且DL≥0.18的化学成分、甘草符合OB≥50%且DL≥0.18的化学成分作为活性成分,并下载相关化合物的靶点信息。

  2.2 靶标蛋白基因名的确定及“成分-靶点”网络的构建

Tags:病毒(436)疫情(1693)中医药(35)

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